Используя компьютерный алгоритм, ученые смогли выявить специфические микробные нуклеиновые кислоты в крови пациентов, что может стать основой для новой методики диагностики злокачественных опухолей.

Бактерии и другие микробы привлекают внимание ученых не только как возможные маркеры рака, но и как потенциальные средства лечения. Известно, что некоторые из них могут стимулировать иммунный ответ, уничтожающий раковые клетки, а также содержат токсичные белки, способные воздействовать на опухоли. Кроме того, бактерии могут быть использованы для доставки противоопухолевых препаратов непосредственно в очаг заболевания. Однако, с другой стороны, микробы могут также способствовать метастазированию, помогая раковым клеткам укореняться в новых местах.

В ходе исследования ученые проанализировали геномные данные более чем 17 тысяч образцов, которые включали как злокачественные опухоли, так и здоровые ткани. Алгоритм, использованный для обработки данных, позволил выделить последовательности ДНК и РНК, относящиеся к бактериям, археям и вирусам. В результате было установлено, что в 12,6% случаев удалось точно определить, к какому микроорганизму относится генетическая последовательность.

Полученные результаты совпали с данными предыдущих исследований, которые показывали связь между определенными бактериями и опухолями различных органов. Алгоритм также был обучен различать опухоли от здоровых тканей и определять типы опухолей на основе микробных признаков. Однако задача по определению стадий опухолей оказалась менее успешной.

В эксперименте, в котором участвовали 169 человек, алгоритм показал свою эффективность в различении здоровых и больных с опухолями легких, предстательной железы и меланомой. Тем не менее, для клинического применения метода требуется дальнейшая доработка на большем количестве случаев и различных типах опухолей.

Несмотря на обнадеживающие результаты, исследование оставляет открытыми некоторые вопросы, в частности, касающиеся чистоты образцов. Возможное загрязнение микробной ДНК из внешних источников может влиять на точность результатов. Ученые подчеркивают необходимость разработки методик, которые позволят более точно определять микробную ДНК в образцах человеческого материала.

Также остается неясным, откуда берется микробная ДНК в опухолях: от живых микробов, обитающих в тканях, или от мертвых микроорганизмов, которые попали в опухоль из других мест. Если в опухолях действительно присутствуют живые микробы, это открывает новые перспективы для исследования их взаимодействия с раковыми клетками и возможности целенаправленного воздействия на них для ослабления опухоли.