Исследование, результаты которого были опубликованы в журнале Nature Communications, открывает новые перспективы для разработки эффективных препаратов против COVID-19.

Вирусы, включая SARS-CoV-2, используют так называемые пептидные мотивы для взаимодействия с белками клеток хозяев. Эти мотивы представляют собой короткие последовательности аминокислот, которые сохраняются в процессе эволюции. Сохранение этих последовательностей объясняется тем, что мутации в них могут привести к утрате способности мотива выполнять свою важную функцию, например, связываться с определенными участками белков, с которыми вирусу необходимо взаимодействовать для заражения.

В ходе исследования ученые смогли выявить 269 взаимодействий между пептидами коронавируса и белками человеческих клеток. Одним из наиболее значимых открытий стало специфическое взаимодействие между белками G3BP1/2 и пептидным мотивом ΦxFG, находящимся в нуклеокапсидном (N) белке SARS-CoV-2. Это взаимодействие играет ключевую роль в репликации вируса и разрушении стрессовых гранул — скоплений белков и РНК в цитозоле клетки, которые участвуют в защитных реакциях организма.

Исследование также показало, что пептидный ингибитор, который нарушает взаимодействие между G3BP1/2 и нуклеокапсидным белком, способен подавлять инфекцию SARS-CoV-2. Это открытие подчеркивает потенциал использования полученных результатов для разработки новых специфических противовирусных препаратов, которые могут значительно улучшить лечение COVID-19 и других вирусных заболеваний.